Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
CTF1Q16619 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CTF1Q16619 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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