Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC85BQ15834 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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