Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PDCD1Q15116 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms