Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KARSQ15046 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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