Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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CHD4Q14839 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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