Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.59□□□□□ -2
FHL3Q13643 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
FHL3Q13643 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
FHL3Q13643 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FHL3Q13643 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FHL3Q13643 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms