Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCIRG1Q13488 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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