Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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