Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMED1Q13445 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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TMED1Q13445 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
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TMED1Q13445 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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TMED1Q13445 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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TMED1Q13445 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
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TMED1Q13445 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMED1Q13445 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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