Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
XRCC4Q13426 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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