Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NR5A1Q13285 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NR5A1Q13285 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms