Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms