Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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TRAF3Q13114 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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TRAF3Q13114 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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TRAF3Q13114 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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TRAF3Q13114 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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