Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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