Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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USP4Q13107 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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USP4Q13107 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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USP4Q13107 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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USP4Q13107 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
USP4Q13107 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
USP4Q13107 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
USP4Q13107 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
USP4Q13107 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
USP4Q13107 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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USP4Q13107 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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USP4Q13107 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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USP4Q13107 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
USP4Q13107 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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USP4Q13107 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
USP4Q13107 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
USP4Q13107 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
USP4Q13107 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
USP4Q13107 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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