Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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IFT88Q13099 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFT88Q13099 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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