Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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