Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms