Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
CTIFO43310 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTIFO43310 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTIFO43310 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTIFO43310 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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