Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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