Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SH3BP4Q9P0V3 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SH3BP4Q9P0V3 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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