Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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ATG3Q9NT62 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATG3Q9NT62 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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