Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SP6Q3SY56 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SP6Q3SY56 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SP6Q3SY56 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SP6Q3SY56 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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