Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
IMPG1Q17R60 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IMPG1Q17R60 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
IMPG1Q17R60 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IMPG1Q17R60 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IMPG1Q17R60 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
IMPG1Q17R60 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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