Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNAPC1Q16533 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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