Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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CNGA3Q16281 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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CNGA3Q16281 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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CNGA3Q16281 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CNGA3Q16281 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CNGA3Q16281 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CNGA3Q16281 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CNGA3Q16281 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CNGA3Q16281 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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