Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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