Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SMAD1Q15797 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SMAD1Q15797 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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