Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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SIX1Q15475 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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SIX1Q15475 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SIX1Q15475 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SIX1Q15475 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SIX1Q15475 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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