Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK3Q15120 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK3Q15120 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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