Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
BRD3Q15059 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BRD3Q15059 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
BRD3Q15059 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BRD3Q15059 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms