Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KARSQ15046 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KARSQ15046 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KARSQ15046 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms