Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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