Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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NFIXQ14938 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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NFIXQ14938 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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NFIXQ14938 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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