Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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