Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GBX1Q14549 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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GBX1Q14549 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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GBX1Q14549 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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GBX1Q14549 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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GBX1Q14549 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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GBX1Q14549 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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