Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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