Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCINQ13939 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCINQ13939 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCINQ13939 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CCINQ13939 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCINQ13939 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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