Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKP1Q13835 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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