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| FHL3 | Q13643 | MGAT4C-211 | ENST00000621808 | 2582 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | PRRG1-202 | ENST00000449135 | 4481 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FHL3 | Q13643 | HEATR5B-201 | ENST00000233099 | 6905 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FHL3 | Q13643 | LINC01359-207 | ENST00000634799 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | BCL2L11-225 | ENST00000640419 | 249 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | SLC9C1-205 | ENST00000487372 | 3979 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | PPP2R5A-205 | ENST00000537030 | 1719 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FHL3 | Q13643 | FAM214A-204 | ENST00000546305 | 3697 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.200-201 | ENST00000364018 | 102 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.277-201 | ENST00000364754 | 102 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RNU6-1310P-201 | ENST00000384153 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.458-201 | ENST00000384240 | 102 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-1274P-201 | ENST00000384557 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-220P-201 | ENST00000390919 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL590399.1-203 | ENST00000412631 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | AP000235.1-201 | ENST00000424017 | 479 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.644-201 | ENST00000459006 | 113 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.674-201 | ENST00000516362 | 113 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | SNORA70.19-201 | ENST00000516717 | 90 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | AP003465.1-201 | ENST00000520575 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | OOSP2-203 | ENST00000532905 | 496 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FHL3 | Q13643 | UBA5-201 | ENST00000264991 | 2850 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF83-201 | ENST00000301096 | 2599 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FHL3 | Q13643 | LUZP2-208 | ENST00000620308 | 4981 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |