Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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CDH18Q13634 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CDH18Q13634 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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