Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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