Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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