Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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