| MPP3 | Q13368 | MIR1298-201 | ENST00000408783 | 112 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | LINC01509-202 | ENST00000423523 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | snoU13.6-201 | ENST00000458785 | 104 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC107626.1-201 | ENST00000471084 | 183 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AP001025.1-201 | ENST00000486139 | 332 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC107016.2-201 | ENST00000547968 | 190 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC113146.1-202 | ENST00000560259 | 433 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR5571-201 | ENST00000577998 | 113 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC023043.3-201 | ENST00000593113 | 385 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR8057-201 | ENST00000620957 | 69 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | DLEU2_6.2-201 | ENST00000620994 | 136 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC127459.3-201 | ENST00000624328 | 466 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL807742.1-203 | ENST00000637444 | 759 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | TBC1D31-214 | ENST00000522420 | 3167 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | IKZF2-213 | ENST00000457361 | 9350 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | CYSLTR1-201 | ENST00000373304 | 2576 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | LMBRD1-201 | ENST00000370570 | 2099 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC138915.1-201 | ENST00000565427 | 1685 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU4-90P-201 | ENST00000362773 | 141 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.180-201 | ENST00000363867 | 113 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-281P-201 | ENST00000384212 | 103 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-541P-201 | ENST00000384709 | 110 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | PCNPP3-201 | ENST00000393579 | 471 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR548M-201 | ENST00000408260 | 86 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | GPM6BP3-201 | ENST00000442797 | 145 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AP000705.1-201 | ENST00000454567 | 350 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MED28P2-201 | ENST00000475771 | 317 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AIG1P1-201 | ENST00000503376 | 148 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC008869.1-201 | ENST00000510938 | 442 nt | TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | SCARNA17.1-201 | ENST00000516211 | 143 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | SCARNA17.2-201 | ENST00000516334 | 143 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | BX546450.2-201 | ENST00000602419 | 435 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | SCARNA17.4-201 | ENST00000614296 | 143 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC005296.1-201 | ENST00000616145 | 209 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR3651-201 | ENST00000630427 | 90 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | PLS1-201 | ENST00000337777 | 3755 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC135776.4-201 | ENST00000624300 | 1904 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | ZNF680-202 | ENST00000447137 | 2159 nt | TSL 2 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL355596.1-201 | ENST00000565399 | 3996 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPAP3-202 | ENST00000380650 | 2149 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | HAUS6P2-201 | ENST00000433254 | 2404 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | ZNF280D-201 | ENST00000267807 | 4328 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR422A-201 | ENST00000362286 | 90 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-961P-201 | ENST00000363893 | 105 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA68.1-201 | ENST00000364537 | 132 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA9.2-201 | ENST00000365361 | 133 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-19P-201 | ENST00000384718 | 107 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-651P-201 | ENST00000411040 | 105 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL513008.1-201 | ENST00000412701 | 161 nt | TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | NCKAP5-IT1-201 | ENST00000416437 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL513477.1-202 | ENST00000417061 | 214 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | PTGES3P4-201 | ENST00000426243 | 356 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC073901.1-201 | ENST00000462471 | 408 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPS27AP9-201 | ENST00000477681 | 438 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC137770.1-201 | ENST00000504620 | 530 nt | TSL 3 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-567P-201 | ENST00000516746 | 107 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-826P-201 | ENST00000516827 | 104 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-58P-201 | ENST00000517143 | 103 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | SCARNA11.3-201 | ENST00000517276 | 130 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AP001318.2-201 | ENST00000533378 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC022809.1-201 | ENST00000579247 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | ST7-AS1_1.1-201 | ENST00000611142 | 116 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | THOC2-201 | ENST00000245838 | 5609 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC009487.2-201 | ENST00000420969 | 6821 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC073346.2-201 | ENST00000624724 | 2058 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC000403.1-201 | ENST00000613696 | 3585 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | DCUN1D1-208 | ENST00000632685 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.83-201 | ENST00000363005 | 113 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-774P-201 | ENST00000363238 | 107 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1141P-201 | ENST00000364520 | 107 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.270-201 | ENST00000364693 | 104 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-142P-201 | ENST00000384019 | 107 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-886P-201 | ENST00000384319 | 105 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR329-1-201 | ENST00000385028 | 80 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR181B1-201 | ENST00000385240 | 110 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-159P-201 | ENST00000391080 | 106 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL136320.1-201 | ENST00000417273 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | U91324.1-201 | ENST00000442864 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | UBBP3-201 | ENST00000445497 | 241 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | ITCH-AS1-201 | ENST00000454205 | 299 nt | TSL 5 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL136164.1-201 | ENST00000456795 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU5F-8P-201 | ENST00000515941 | 111 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RN7SKP49-201 | ENST00000516675 | 260 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | ACA59.2-201 | ENST00000517061 | 156 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL137100.2-201 | ENST00000555786 | 315 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC009163.5-201 | ENST00000575421 | 637 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR4423-201 | ENST00000580922 | 80 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR5195-201 | ENST00000583555 | 115 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPL12P50-201 | ENST00000603116 | 116 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL356157.2-201 | ENST00000605122 | 111 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | LINC01206-214 | ENST00000610910 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL357075.2-201 | ENST00000614906 | 189 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | NPPA-AS1_3.1-201 | ENST00000617059 | 108 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | FO624990.1-201 | ENST00000636373 | 85 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR7515-201 | ENST00000637837 | 67 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | CCDC66-201 | ENST00000326595 | 3027 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| MPP3 | Q13368 | FTX-214 | ENST00000638437 | 12267 nt | TSL 5 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.44-201 | ENST00000362676 | 108 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.199-201 | ENST00000364014 | 102 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-740P-201 | ENST00000364734 | 105 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |