Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms