Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SRSF5Q13243 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms