Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EFEMP1Q12805 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EFEMP1Q12805 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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