Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TWF1Q12792 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TWF1Q12792 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TWF1Q12792 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TWF1Q12792 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TWF1Q12792 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TWF1Q12792 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TWF1Q12792 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TWF1Q12792 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TWF1Q12792 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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