Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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GTF3C1Q12789 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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GTF3C1Q12789 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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GTF3C1Q12789 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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GTF3C1Q12789 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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GTF3C1Q12789 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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GTF3C1Q12789 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF3C1Q12789 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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